《御赐小仵作》中的角色关系还挺复杂的，男女主角的身世都不简单。当年甘露之变发生后，宦官获得了胜利，因此朝中很多正直的官员都受到了打压，甚至背负污名。这次楚楚和萧瑾瑜为了替父母翻案也是吃了很多苦，那目前距离真相是越来越近，云易一直被认为是反贼，他应该也是被冤枉。那云易和楚楚之间，实际上有着密不可分的关系。
云易是谁
云易是楚楚的父亲。当年萧恒来到远方，想要平息所谓的叛乱，这时他才发现原来真正的叛党并不是云易和陈璎，反而是他们一直被当地的地头蛇欺压。不仅如此，皇帝派来协助萧恒的太监也是一个内奸，他用尽诡计想要杀死陈璎和萧恒二人。
只有这样萧恒才不会将事情的真相说出，云易叛党的名胜才能够彻底坐实，果然他的诡计得逞了。陈璎和萧恒二人都被他逼下了悬崖，所有的人都以为他们两个人已经死了。而云易的妻子许氏就在这个时候回到了家乡，可是却没有想到自己的家人害怕被丈夫连累，全部逃走了。
楚楚身世
此后许氏受到了很多流言蜚语的骚扰，她知道大家都嫌弃自己，所以在怀着楚楚的时候就撞墙自尽了。在楚家的人想要将这个可怜的女子掩埋的时候，却发现她肚子里面八个月大的孩子竟然还活着，楚家的老爷起了恻隐之心，就将楚楚收留了下来，并且隐姓埋名，让她成为了楚家的女儿。
楚楚一直不知道自己的身世，而且楚家的每一个人对她都很好，虽然外界有流言蜚语，说她是楚家老爷的私生女儿，不过楚楚却从来不在意这些。不仅如此，萧恒在知道楚楚还活着的时候，也赶来了这里，并且成为了楚楚的师傅，教给了她很多有用的东西。
他觉得是自己对不起自己的好友，所以才使得楚楚从小就没有父母，楚楚在学会了本事以后，竟然去了长安，而且见到了萧恒的亲生儿子萧瑾瑜。两个人之间发生了很多啼笑皆非的故事，最后楚楚和萧瑾瑜二人走到了一起，萧恒也说出了当年事情的真相。
